SIMULASI DINAMIKA MOLEKULER PROTEIN DENGAN APLIKASI GROMACS

Astuti, Anastasia Dwi and Mutiara , A Benny SIMULASI DINAMIKA MOLEKULER PROTEIN DENGAN APLIKASI GROMACS. Skripsi Program Studi Teknik Informatika. (Submitted)

[img]
Preview
Text
SIMULASI DINAMIKA MOLEKULER PROTEIN _UG.pdf - Submitted Version

Download (227Kb) | Preview

Abstract

Perkembangan teknologi komputer dalam bidang kimia memunculkan banyak aplikasi kimia. Tidak hanya aplikasi untuk memvisualisasikan struktur molekul tapi juga untuk simulasi dinamika molekuler. Salah satunya adalah Gromacs. Gromacs merupakan contoh aplikasi dinamika molekuler yang dikembangkan oleh universitas Groningen. Aplikasi ini bersifat non-komersial dan mampu bekerja dalam sistem operasi Linux. Kemampuan utama Gromacs adalah melakukan simulasi dinamika molekuler serta penyusutan energi. Dalam penulisan ini, penulis membahas mengenai bagaimana cara kerja Gromacs dalam simulasi dinamika molekuler beberapa protein. Dalam melakukan simulasi dinamika molekuler, Gromacs tidak bekerja sendiri. Gromacs berinteraksi dengan aplikasi Pymol serta aplikasi Grace. Pymol merupakan aplikasi untuk menvisualisasikan hasil simulasi sedangkan Grace merupakan aplikasi dalam linux untuk menampilkan grafik. Kedua aplikasi ini mendukung dalam hal analisis hasil simulasi dinamika molekuler dengan Gromacs.

Item Type: Article
Uncontrolled Keywords: dinamika molekuler; Gromacs; Linux; pymol; grace; kimia
Subjects: A General Works > AI Indexes (General)
Divisions: Fakultas Teknologi Industri > Program Studi Teknik Informatika
Depositing User: Mr Reza Chandra
Date Deposited: 28 Feb 2014 07:47
Last Modified: 28 Feb 2014 07:47
URI: http://repository.gunadarma.ac.id/id/eprint/993

Actions (login required)

View Item View Item